Нехватка нумерации в начале.

Array
(
    [0] => .
    [1] => ..
    [2] => 001_example.dat
    [3] => 002_example.dat
)
Следующий номер - 000

Нехватка нумерации в середине.

Array
(
    [0] => .
    [1] => ..
    [2] => 000_example.dat
    [3] => 002_example.dat
)
Следующий номер - 001

Нехватка нумерации в конце.

Array
(
    [0] => .
    [1] => ..
    [2] => 000_example.dat
    [3] => 001_example.dat
)
Следующий номер - 002